Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGSNQ5TDP6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms