Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D2

TREML2, Trem-like transcript 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML2Q5T2D2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TREML2Q5T2D2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TREML2Q5T2D2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TREML2Q5T2D2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TREML2Q5T2D2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TREML2Q5T2D2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TREML2Q5T2D2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TREML2Q5T2D2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TREML2Q5T2D2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TREML2Q5T2D2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TREML2Q5T2D2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TREML2Q5T2D2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TREML2Q5T2D2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TREML2Q5T2D2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TREML2Q5T2D2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TREML2Q5T2D2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TREML2Q5T2D2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TREML2Q5T2D2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TREML2Q5T2D2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TREML2Q5T2D2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TREML2Q5T2D2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TREML2Q5T2D2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TREML2Q5T2D2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TREML2Q5T2D2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TREML2Q5T2D2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TREML2Q5T2D2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TREML2Q5T2D2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TREML2Q5T2D2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TREML2Q5T2D2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TREML2Q5T2D2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TREML2Q5T2D2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TREML2Q5T2D2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TREML2Q5T2D2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TREML2Q5T2D2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TREML2Q5T2D2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TREML2Q5T2D2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TREML2Q5T2D2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TREML2Q5T2D2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms