Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP188Q5SRE5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms