Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATAT1Q5SQI0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms