Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIA9

CBWD5, COBW domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBWD5Q5RIA9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CBWD5Q5RIA9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms