Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EFHC1Q5JVL4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms