Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KHDC3LQ587J8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms