Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms