Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXU2

PABPC1L, Polyadenylate-binding protein 1-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1LQ4VXU2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC1LQ4VXU2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC1LQ4VXU2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms