Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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