Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms