Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
KRTAP13-4Q3LI77 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
KRTAP13-4Q3LI77 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
KRTAP13-4Q3LI77 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
KRTAP13-4Q3LI77 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
KRTAP13-4Q3LI77 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
KRTAP13-4Q3LI77 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
KRTAP13-4Q3LI77 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
KRTAP13-4Q3LI77 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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KRTAP13-4Q3LI77 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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KRTAP13-4Q3LI77 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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