Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGSM1Q2NKQ1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM1Q2NKQ1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms