Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.737e-11■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 VEGFA-220ENST00000519767 970 ntTSL 1 (best)19.58■□□□□ 0.727e-11■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 TANGO2-222ENST00000479679 894 ntTSL 219.42■□□□□ 0.79e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.669e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.629e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 TANGO2-215ENST00000450019 1689 ntTSL 518.92■□□□□ 0.629e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.569e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.59e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.469e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.459e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.427e-11■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 TANGO2-208ENST00000430807 733 ntTSL 317.42■□□□□ 0.389e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 TANGO2-206ENST00000411907 568 ntTSL 417.35■□□□□ 0.379e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.349e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.047e-11■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 TANGO2-211ENST00000434168 862 ntTSL 314.34□□□□□ -0.119e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.127e-11■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 CCNL1-207ENST00000465947 793 ntTSL 514.27□□□□□ -0.131e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 TANGO2-203ENST00000399807 2241 ntTSL 513.48□□□□□ -0.259e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 TANGO2-216ENST00000450664 570 ntTSL 413.42□□□□□ -0.269e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.311e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 TANGO2-219ENST00000471707 745 ntTSL 512.53□□□□□ -0.49e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 TANGO2-218ENST00000462579 649 ntTSL 412.5□□□□□ -0.419e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.449e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.489e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 CCNL1-222ENST00000479596 883 ntTSL 311.66□□□□□ -0.541e-6■□□□□ 10.2
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SRSF7Q16629 TANGO2-220ENST00000475446 557 ntTSL 410.99□□□□□ -0.659e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 TPTEP1-204ENST00000426585 5725 ntTSL 1 (best)10.79□□□□□ -0.689e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 TANGO2-223ENST00000484373 3109 ntTSL 410.79□□□□□ -0.689e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 TANGO2-224ENST00000485715 617 ntTSL 510.32□□□□□ -0.769e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 TANGO2-209ENST00000432198 585 ntTSL 49.43□□□□□ -0.99e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 LRIF1-201ENST00000369763 3475 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.959e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 TPTEP1-203ENST00000415121 1067 ntTSL 1 (best)7.67□□□□□ -1.189e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 BUB1B-201ENST00000287598 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.249e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 BUB1B-202ENST00000412359 3628 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.289e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 TPTEP1-201ENST00000383140 971 ntTSL 1 (best)6.66□□□□□ -1.349e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 CCNL1-209ENST00000467081 564 ntTSL 36.66□□□□□ -1.349e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 CCNL1-220ENST00000478454 580 ntTSL 44.46□□□□□ -1.79e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 BUB1B-209ENST00000559733 786 ntTSL 34.12□□□□□ -1.759e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 BUB1B-203ENST00000557848 633 ntTSL 33.76□□□□□ -1.819e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 CCNL1-205ENST00000464575 505 ntTSL 43.67□□□□□ -1.829e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.939e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 BUB1B-210ENST00000559772 560 ntTSL 42.76□□□□□ -1.979e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 LUC7L-218ENST00000494366 668 ntTSL 315.1■□□□□ 0.014e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 LUC7L-216ENST00000469109 950 ntTSL 1 (best)10.17□□□□□ -0.784e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 LUC7L-203ENST00000397780 1335 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.84e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 LUC7L-208ENST00000428363 498 ntTSL 59.5□□□□□ -0.894e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 EIF5B-205ENST00000617677 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.911e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 EIF5B-201ENST00000289371 5777 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.191e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 LUC7L-212ENST00000443357 833 ntTSL 25.57□□□□□ -1.524e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.431e-7■□□□□ 10.1
SRSF7Q16629 LRP5-206ENST00000529993 5103 ntTSL 1 (best)12.41□□□□□ -0.421e-7■□□□□ 10.1
SRSF7Q16629 EIF4G2-207ENST00000525995 592 ntTSL 416.77■□□□□ 0.285e-8■□□□□ 10.1
SRSF7Q16629 EIF4G2-203ENST00000524932 1286 ntTSL 516.19■□□□□ 0.185e-8■□□□□ 10.1
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SRSF7Q16629 EIF4G2-221ENST00000532082 1069 ntTSL 1 (best)9.09□□□□□ -0.955e-8■□□□□ 10.1
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SRSF7Q16629 EIF4G2-232ENST00000640650 2724 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.145e-8■□□□□ 10.1
SRSF7Q16629 EIF4G2-225ENST00000532383 6769 ntTSL 1 (best)7.91□□□□□ -1.145e-8■□□□□ 10.1
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SRSF7Q16629 EIF4G2-201ENST00000339995 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.195e-8■□□□□ 10.1
SRSF7Q16629 EIF4G2-212ENST00000528562 601 ntTSL 47.31□□□□□ -1.245e-8■□□□□ 10.1
SRSF7Q16629 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.325e-8■□□□□ 10.1
SRSF7Q16629 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.385e-8■□□□□ 10.1
SRSF7Q16629 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.465e-8■□□□□ 10.1
SRSF7Q16629 EIF4G2-206ENST00000525972 584 ntTSL 24.96□□□□□ -1.625e-8■□□□□ 10.1
SRSF7Q16629 EIF4G2-223ENST00000532152 587 ntTSL 24.32□□□□□ -1.725e-8■□□□□ 10.1
SRSF7Q16629 EIF4G2-231ENST00000534605 198 ntTSL 3-0.43□□□□□ -2.485e-8■□□□□ 10.1
SRSF7Q16629 COL27A1-208ENST00000494780 514 ntTSL 417.84■□□□□ 0.451e-7■□□□□ 10.1
SRSF7Q16629 COL27A1-207ENST00000494090 5329 ntTSL 1 (best)16■□□□□ 0.151e-7■□□□□ 10.1
SRSF7Q16629 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.031e-7■□□□□ 10.1
SRSF7Q16629 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.251e-9■□□□□ 10
SRSF7Q16629 HNRNPA1-209ENST00000550482 832 ntTSL 211.67□□□□□ -0.541e-9■□□□□ 10
SRSF7Q16629 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.591e-9■□□□□ 10
SRSF7Q16629 HNRNPA1-206ENST00000547708 530 ntTSL 48.73□□□□□ -1.011e-9■□□□□ 10
SRSF7Q16629 HNRNPA1-204ENST00000547276 1539 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.331e-9■□□□□ 10
SRSF7Q16629 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.242e-7■□□□□ 10
SRSF7Q16629 HSP90B1-202ENST00000540297 590 ntTSL 315.82■□□□□ 0.122e-7■□□□□ 10
SRSF7Q16629 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.83□□□□□ -0.22e-7■□□□□ 10
SRSF7Q16629 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.232e-7■□□□□ 10
SRSF7Q16629 HSP90B1-205ENST00000549334 581 ntTSL 413.43□□□□□ -0.262e-7■□□□□ 10
SRSF7Q16629 HSP90B1-204ENST00000548622 839 ntTSL 213.29□□□□□ -0.282e-7■□□□□ 10
SRSF7Q16629 RHOBTB3-205ENST00000504949 1511 ntTSL 29.85□□□□□ -0.832e-7■□□□□ 10
SRSF7Q16629 ARL15-205ENST00000507646 578 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.972e-7■□□□□ 10
SRSF7Q16629 RHOBTB3-202ENST00000502541 693 ntTSL 55.55□□□□□ -1.522e-7■□□□□ 10
SRSF7Q16629 HNRNPC-215ENST00000555127 929 ntTSL 25.23□□□□□ -1.572e-7■□□□□ 10
SRSF7Q16629 ARL15-206ENST00000510591 804 ntTSL 54.55□□□□□ -1.682e-7■□□□□ 10
SRSF7Q16629 RHOBTB3-211ENST00000510623 333 ntTSL 23.78□□□□□ -1.82e-7■□□□□ 10
SRSF7Q16629 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.812e-7■□□□□ 10
SRSF7Q16629 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.812e-7■□□□□ 10
SRSF7Q16629 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.781e-8■□□□□ 10
SRSF7Q16629 LSM7-202ENST00000585395 621 ntTSL 318.69■□□□□ 0.581e-8■□□□□ 10
SRSF7Q16629 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.581e-8■□□□□ 10
SRSF7Q16629 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.511e-8■□□□□ 10
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