Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STX1AQ16623 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
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