Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITSN1Q15811 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
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