Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNHIT3Q15649 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms