Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH1Q15438 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms