Protein–RNA interactions for Protein: Q15370

ELOB, Elongin-B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOBQ15370 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELOBQ15370 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms