Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
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