Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKD1Q15139 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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