Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KARSQ15046 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KARSQ15046 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KARSQ15046 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KARSQ15046 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KARSQ15046 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KARSQ15046 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KARSQ15046 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KARSQ15046 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KARSQ15046 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KARSQ15046 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KARSQ15046 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KARSQ15046 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KARSQ15046 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KARSQ15046 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KARSQ15046 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KARSQ15046 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KARSQ15046 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KARSQ15046 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KARSQ15046 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KARSQ15046 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KARSQ15046 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KARSQ15046 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KARSQ15046 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KARSQ15046 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KARSQ15046 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KARSQ15046 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KARSQ15046 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KARSQ15046 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KARSQ15046 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KARSQ15046 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KARSQ15046 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KARSQ15046 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KARSQ15046 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KARSQ15046 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KARSQ15046 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KARSQ15046 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KARSQ15046 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KARSQ15046 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KARSQ15046 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KARSQ15046 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KARSQ15046 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KARSQ15046 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KARSQ15046 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KARSQ15046 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KARSQ15046 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KARSQ15046 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KARSQ15046 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KARSQ15046 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KARSQ15046 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KARSQ15046 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KARSQ15046 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KARSQ15046 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KARSQ15046 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KARSQ15046 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KARSQ15046 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KARSQ15046 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KARSQ15046 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KARSQ15046 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KARSQ15046 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KARSQ15046 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KARSQ15046 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KARSQ15046 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KARSQ15046 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KARSQ15046 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KARSQ15046 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KARSQ15046 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KARSQ15046 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KARSQ15046 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KARSQ15046 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KARSQ15046 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KARSQ15046 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KARSQ15046 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KARSQ15046 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KARSQ15046 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KARSQ15046 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KARSQ15046 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KARSQ15046 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KARSQ15046 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KARSQ15046 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KARSQ15046 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KARSQ15046 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KARSQ15046 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KARSQ15046 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KARSQ15046 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KARSQ15046 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KARSQ15046 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KARSQ15046 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KARSQ15046 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KARSQ15046 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KARSQ15046 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KARSQ15046 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KARSQ15046 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KARSQ15046 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KARSQ15046 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KARSQ15046 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KARSQ15046 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KARSQ15046 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KARSQ15046 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KARSQ15046 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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