Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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