Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
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