Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SQLEQ14534 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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