Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BECN1Q14457 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
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