Protein–RNA interactions for Protein: Q14114

LRP8, Low-density lipoprotein receptor-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP8Q14114 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP8Q14114 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP8Q14114 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms