Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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