Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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