Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PKD2Q13563 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
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