Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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SCGB2A2Q13296 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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SCGB2A2Q13296 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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SCGB2A2Q13296 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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SCGB2A2Q13296 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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SCGB2A2Q13296 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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SCGB2A2Q13296 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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SCGB2A2Q13296 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCGB2A2Q13296 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCGB2A2Q13296 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCGB2A2Q13296 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCGB2A2Q13296 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCGB2A2Q13296 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCGB2A2Q13296 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCGB2A2Q13296 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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