Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
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