Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
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