Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MRPL28Q13084 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms