Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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