Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC37.26■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
PRDM2Q13029 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
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