Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK3Q13003 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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