Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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