Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
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GTF3C1Q12789 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
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GTF3C1Q12789 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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GTF3C1Q12789 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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GTF3C1Q12789 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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