Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 SWC7YLR385C 399 nt4.74□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 REH1YLR387C 1299 nt4.74□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 PRX1YBL064C 786 nt4.74□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 YPT53YNL093W 663 nt4.74□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 CCL1YPR025C 1182 nt4.74□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 PDR12YPL058C 4536 nt4.74□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 KTR6YPL053C 1341 nt4.73□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 YDR220CYDR220C 294 nt4.73□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 SRB7YDR308C 423 nt4.73□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 YGL204CYGL204C 306 nt4.73□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 YGL214WYGL214W 486 nt4.73□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 COX6YHR051W 447 nt4.73□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 PCL7YIL050W 858 nt4.73□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 YKR051WYKR051W 1257 nt4.73□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 MMM1YLL006W 1281 nt4.73□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 IDI1YPL117C 867 nt4.73□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 SUA7YPR086W 1038 nt4.73□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 VPS69YPR087W 321 nt4.73□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 snR37snR37 386 nt4.73□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 YBR287WYBR287W 1284 nt4.73□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 MET17YLR303W 1335 nt4.72□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 UBP6YFR010W 1500 nt4.72□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 RPP1AYDL081C 321 nt4.72□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 YDL228CYDL228C 642 nt4.72□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 NBP2YDR162C 711 nt4.72□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 RPL24AYGL031C 468 nt4.72□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 MRP4YHL004W 1185 nt4.72□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt4.72□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 YJL028WYJL028W 336 nt4.72□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 YBR063CYBR063C 1215 nt4.72□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 GAT2YMR136W 1683 nt4.72□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 TDA3YHR009C 1572 nt4.71□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 SKG6YHR149C 2205 nt4.71□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 RAV2YDR202C 1056 nt4.71□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt4.71□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 MIC26YGR235C 702 nt4.71□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.71□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 RDN5-1RDN5-1 121 nt4.71□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 RDN5-6RDN5-6 121 nt4.71□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 RPC34YNR003C 954 nt4.71□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 PTR3YFR029W 2037 nt4.71□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 RSC3YDR303C 2658 nt4.7□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 NAM2YLR382C 2685 nt4.7□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 ALR2YFL050C 2577 nt4.7□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 RPN4YDL020C 1596 nt4.7□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 NUG1YER006W 1563 nt4.7□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 LOS1YKL205W 3303 nt4.7□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 HSP42YDR171W 1128 nt4.7□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 ATP5YDR298C 639 nt4.7□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 RPN9YDR427W 1182 nt4.7□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 IRC22YEL001C 678 nt4.7□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 YGL117WYGL117W 798 nt4.7□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 PRP18YGR006W 756 nt4.7□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 YJL218WYJL218W 591 nt4.7□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 MRPL20YKR085C 588 nt4.7□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 YAR030CYAR030C 342 nt4.7□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 OLE1YGL055W 1533 nt4.7□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt4.7□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 SUP45YBR143C 1314 nt4.7□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 SPB4YFL002C 1821 nt4.69□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 URC2YDR520C 2319 nt4.69□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 MGA1YGR249W 1371 nt4.69□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 RSC58YLR033W 1509 nt4.69□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 YCL075WYCL075W 441 nt4.69□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 ARC15YIL062C 465 nt4.69□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 YMR130WYMR130W 909 nt4.69□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 YOR131CYOR131C 657 nt4.69□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 SNF8YPL002C 702 nt4.69□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 RPL19AYBR084C-A 570 nt4.69□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 YPR177CYPR177C 372 nt4.69□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 KRE29YER038C 1395 nt4.68□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 SAG1YJR004C 1953 nt4.68□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 MEI4YER044C-A 1227 nt4.68□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 COX4YGL187C 468 nt4.68□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 COS12YGL263W 1143 nt4.68□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 BET1YIL004C 429 nt4.68□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 FIP1YJR093C 984 nt4.68□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 YBL059WYBL059W 582 nt4.68□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 OXR1YPL196W 822 nt4.68□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 YOL153CYOL153C 1746 nt4.68□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 SWP82YFL049W 1872 nt4.68□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 PST1YDR055W 1335 nt4.68□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 ERT1YBR239C 1590 nt4.67□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt4.67□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 MRPL17YNL252C 846 nt4.67□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 snR11snR11 258 nt4.67□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 YOR169CYOR169C 465 nt4.67□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 PMS1YNL082W 2622 nt4.67□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 YDL094CYDL094C 510 nt4.66□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 AIM19YIL087C 474 nt4.66□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 SFH1YLR321C 1281 nt4.66□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 HTA2YBL003C 399 nt4.66□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 YMR099CYMR099C 894 nt4.66□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 TRI1YMR233W 681 nt4.66□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 TOM7YNL070W 183 nt4.66□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 YOR338WYOR338W 1092 nt4.66□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 JID1YPR061C 906 nt4.66□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 YHR202WYHR202W 1809 nt4.66□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 SIP1YDR422C 2448 nt4.66□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 MSA1YOR066W 1890 nt4.66□□□□□ -1.66
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