Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms