Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-1Q07627 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms