Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FMODQ06828 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FMODQ06828 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FMODQ06828 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FMODQ06828 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FMODQ06828 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FMODQ06828 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FMODQ06828 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FMODQ06828 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FMODQ06828 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FMODQ06828 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FMODQ06828 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FMODQ06828 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FMODQ06828 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FMODQ06828 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FMODQ06828 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FMODQ06828 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FMODQ06828 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FMODQ06828 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FMODQ06828 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FMODQ06828 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FMODQ06828 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FMODQ06828 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FMODQ06828 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FMODQ06828 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FMODQ06828 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FMODQ06828 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FMODQ06828 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FMODQ06828 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FMODQ06828 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FMODQ06828 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FMODQ06828 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FMODQ06828 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FMODQ06828 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FMODQ06828 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FMODQ06828 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FMODQ06828 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FMODQ06828 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FMODQ06828 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FMODQ06828 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FMODQ06828 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FMODQ06828 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FMODQ06828 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FMODQ06828 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FMODQ06828 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FMODQ06828 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FMODQ06828 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FMODQ06828 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FMODQ06828 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FMODQ06828 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FMODQ06828 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FMODQ06828 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FMODQ06828 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FMODQ06828 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FMODQ06828 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FMODQ06828 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FMODQ06828 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FMODQ06828 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FMODQ06828 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FMODQ06828 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FMODQ06828 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FMODQ06828 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FMODQ06828 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FMODQ06828 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FMODQ06828 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FMODQ06828 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FMODQ06828 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FMODQ06828 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FMODQ06828 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FMODQ06828 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FMODQ06828 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FMODQ06828 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FMODQ06828 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FMODQ06828 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FMODQ06828 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FMODQ06828 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FMODQ06828 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FMODQ06828 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FMODQ06828 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FMODQ06828 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FMODQ06828 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FMODQ06828 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FMODQ06828 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FMODQ06828 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FMODQ06828 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FMODQ06828 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FMODQ06828 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FMODQ06828 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FMODQ06828 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FMODQ06828 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FMODQ06828 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FMODQ06828 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FMODQ06828 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FMODQ06828 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FMODQ06828 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FMODQ06828 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FMODQ06828 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FMODQ06828 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FMODQ06828 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FMODQ06828 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms