Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCZQ05513 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCZQ05513 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms