Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD164Q04900 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD164Q04900 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD164Q04900 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD164Q04900 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD164Q04900 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD164Q04900 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD164Q04900 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD164Q04900 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD164Q04900 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD164Q04900 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD164Q04900 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD164Q04900 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD164Q04900 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD164Q04900 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD164Q04900 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD164Q04900 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD164Q04900 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD164Q04900 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD164Q04900 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD164Q04900 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD164Q04900 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD164Q04900 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD164Q04900 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD164Q04900 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CD164Q04900 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD164Q04900 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD164Q04900 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CD164Q04900 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD164Q04900 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD164Q04900 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms