Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ATP7AQ04656 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms