Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPCQ03188 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms