Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP27A1Q02318 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms