Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHDQ02161 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHDQ02161 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHDQ02161 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHDQ02161 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHDQ02161 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RHDQ02161 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHDQ02161 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHDQ02161 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHDQ02161 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHDQ02161 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RHDQ02161 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHDQ02161 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHDQ02161 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHDQ02161 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHDQ02161 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHDQ02161 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHDQ02161 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHDQ02161 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHDQ02161 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHDQ02161 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHDQ02161 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHDQ02161 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RHDQ02161 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHDQ02161 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHDQ02161 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHDQ02161 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHDQ02161 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHDQ02161 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHDQ02161 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHDQ02161 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RHDQ02161 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHDQ02161 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHDQ02161 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHDQ02161 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHDQ02161 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHDQ02161 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHDQ02161 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHDQ02161 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHDQ02161 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHDQ02161 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHDQ02161 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHDQ02161 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHDQ02161 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHDQ02161 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHDQ02161 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHDQ02161 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHDQ02161 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHDQ02161 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHDQ02161 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHDQ02161 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHDQ02161 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHDQ02161 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHDQ02161 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHDQ02161 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHDQ02161 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHDQ02161 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHDQ02161 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHDQ02161 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHDQ02161 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHDQ02161 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RHDQ02161 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHDQ02161 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHDQ02161 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHDQ02161 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHDQ02161 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHDQ02161 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHDQ02161 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHDQ02161 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHDQ02161 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHDQ02161 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHDQ02161 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHDQ02161 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHDQ02161 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHDQ02161 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHDQ02161 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHDQ02161 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHDQ02161 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHDQ02161 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHDQ02161 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHDQ02161 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHDQ02161 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHDQ02161 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHDQ02161 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHDQ02161 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RHDQ02161 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHDQ02161 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHDQ02161 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHDQ02161 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHDQ02161 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHDQ02161 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHDQ02161 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RHDQ02161 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHDQ02161 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHDQ02161 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHDQ02161 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHDQ02161 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RHDQ02161 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHDQ02161 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHDQ02161 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms