Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEFA6Q01524 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms